MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Korarchaeum cryptofilum OPF8 chromosome

Total Repeats: 33777

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010482	CCA	2	6	10	15	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_010482	GGA	2	6	33	38	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010482	GGA	2	6	60	65	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010482	AGG	2	6	145	150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289628
5	NC_010482	AG	3	6	174	179	50 %	0 %	50 %	0 %	170289628
6	NC_010482	A	6	6	180	185	100 %	0 %	0 %	0 %	170289628
7	NC_010482	A	6	6	192	197	100 %	0 %	0 %	0 %	170289628
8	NC_010482	CT	3	6	210	215	0 %	50 %	0 %	50 %	170289628
9	NC_010482	AG	3	6	227	232	50 %	0 %	50 %	0 %	170289628
10	NC_010482	GCT	2	6	235	240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289628
11	NC_010482	ATG	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289628
12	NC_010482	CAA	2	6	431	436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289628
13	NC_010482	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289628
14	NC_010482	CT	3	6	489	494	0 %	50 %	0 %	50 %	170289628
15	NC_010482	GGA	2	6	495	500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289628
16	NC_010482	ATA	2	6	613	618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289628
17	NC_010482	GCT	3	9	666	674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289628
18	NC_010482	GATA	2	8	684	691	50 %	25 %	25 %	0 %	170289628
19	NC_010482	CGA	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289628
20	NC_010482	TGG	2	6	818	823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289628
21	NC_010482	AAT	2	6	861	866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289628
22	NC_010482	GAT	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289628
23	NC_010482	TTCA	2	8	1027	1034	25 %	50 %	0 %	25 %	170289628
24	NC_010482	TCC	2	6	1118	1123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289628
25	NC_010482	GGA	2	6	1125	1130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289628
26	NC_010482	GTG	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170289628
27	NC_010482	TTG	2	6	1262	1267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170289629
28	NC_010482	CAT	2	6	1313	1318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289629
29	NC_010482	GATA	2	8	1413	1420	50 %	25 %	25 %	0 %	170289629
30	NC_010482	G	6	6	1440	1445	0 %	0 %	100 %	0 %	170289629
31	NC_010482	ACA	2	6	1481	1486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170289629
32	NC_010482	TGCGA	2	10	1618	1627	20 %	20 %	40 %	20 %	170289629
33	NC_010482	TC	3	6	1644	1649	0 %	50 %	0 %	50 %	170289629
34	NC_010482	CCCT	2	8	1695	1702	0 %	25 %	0 %	75 %	170289629
35	NC_010482	GGA	2	6	1704	1709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289629
36	NC_010482	GTC	2	6	1750	1755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289629
37	NC_010482	AGGT	2	8	1757	1764	25 %	25 %	50 %	0 %	170289629
38	NC_010482	TCG	2	6	1769	1774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289629
39	NC_010482	G	7	7	1879	1885	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010482	TCC	2	6	1964	1969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_010482	CGG	2	6	1998	2003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010482	ACC	2	6	2042	2047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_010482	AGC	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010482	TGC	2	6	2095	2100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010482	A	6	6	2183	2188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010482	GCT	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289630
47	NC_010482	TA	3	6	2242	2247	50 %	50 %	0 %	0 %	170289630
48	NC_010482	TAT	2	6	2250	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289630
49	NC_010482	CAT	2	6	2333	2338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289630
50	NC_010482	CCT	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010482	GCTA	2	8	2445	2452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010482	TGGG	2	8	2458	2465	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010482	TTTAA	2	10	2466	2475	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010482	T	6	6	2476	2481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010482	TA	3	6	2520	2525	50 %	50 %	0 %	0 %	170289631
56	NC_010482	T	6	6	2552	2557	0 %	100 %	0 %	0 %	170289631
57	NC_010482	TAT	2	6	2572	2577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289631
58	NC_010482	TC	3	6	2586	2591	0 %	50 %	0 %	50 %	170289631
59	NC_010482	AAT	2	6	2604	2609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289631
60	NC_010482	TCCA	2	8	2646	2653	25 %	25 %	0 %	50 %	170289631
61	NC_010482	CCT	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289631
62	NC_010482	CT	3	6	2671	2676	0 %	50 %	0 %	50 %	170289631
63	NC_010482	TTTA	2	8	2726	2733	25 %	75 %	0 %	0 %	170289631
64	NC_010482	TAT	2	6	2788	2793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289631
65	NC_010482	AG	3	6	2813	2818	50 %	0 %	50 %	0 %	170289631
66	NC_010482	TA	3	6	2911	2916	50 %	50 %	0 %	0 %	170289631
67	NC_010482	GGA	2	6	3037	3042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289632
68	NC_010482	AGG	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289632
69	NC_010482	CTCC	2	8	3057	3064	0 %	25 %	0 %	75 %	170289632
70	NC_010482	TCG	2	6	3084	3089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289632
71	NC_010482	AGG	2	6	3120	3125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289632
72	NC_010482	AGGA	2	8	3182	3189	50 %	0 %	50 %	0 %	170289632
73	NC_010482	ATA	2	6	3191	3196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289632
74	NC_010482	TGA	3	9	3199	3207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289632
75	NC_010482	GGC	2	6	3235	3240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170289632
76	NC_010482	ATA	2	6	3257	3262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289632
77	NC_010482	AAG	2	6	3326	3331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289632
78	NC_010482	TAGC	2	8	3396	3403	25 %	25 %	25 %	25 %	170289632
79	NC_010482	TC	3	6	3431	3436	0 %	50 %	0 %	50 %	170289632
80	NC_010482	ATA	2	6	3491	3496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289632
81	NC_010482	GTC	2	6	3549	3554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289633
82	NC_010482	TCT	2	6	3648	3653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289633
83	NC_010482	TC	3	6	3843	3848	0 %	50 %	0 %	50 %	170289633
84	NC_010482	CCT	2	6	3851	3856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289633
85	NC_010482	TCA	2	6	3908	3913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289633
86	NC_010482	TC	3	6	3922	3927	0 %	50 %	0 %	50 %	170289633
87	NC_010482	TCC	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289633
88	NC_010482	GGA	2	6	4140	4145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289633
89	NC_010482	CGA	2	6	4148	4153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289633
90	NC_010482	CTC	3	9	4177	4185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289633
91	NC_010482	CTC	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289633
92	NC_010482	CTC	2	6	4305	4310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289633
93	NC_010482	CTC	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289633
94	NC_010482	CCT	2	6	4469	4474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289633
95	NC_010482	GA	3	6	4517	4522	50 %	0 %	50 %	0 %	170289633
96	NC_010482	G	6	6	4651	4656	0 %	0 %	100 %	0 %	170289633
97	NC_010482	GAT	2	6	4722	4727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289633
98	NC_010482	ATC	2	6	4776	4781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289633
99	NC_010482	GAT	2	6	4840	4845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289633
100	NC_010482	CCCTA	2	10	4920	4929	20 %	20 %	0 %	60 %	170289633
101	NC_010482	TC	3	6	5060	5065	0 %	50 %	0 %	50 %	170289633
102	NC_010482	TCA	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289633
103	NC_010482	ACG	2	6	5128	5133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289633
104	NC_010482	CT	4	8	5181	5188	0 %	50 %	0 %	50 %	170289633
105	NC_010482	CGATA	2	10	5340	5349	40 %	20 %	20 %	20 %	170289633
106	NC_010482	T	6	6	5390	5395	0 %	100 %	0 %	0 %	170289633
107	NC_010482	ATA	2	6	5422	5427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289633
108	NC_010482	ACC	2	6	5484	5489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170289634
109	NC_010482	TCA	2	6	5513	5518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289634
110	NC_010482	TTA	2	6	5583	5588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289634
111	NC_010482	CCT	2	6	5634	5639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289634
112	NC_010482	CT	3	6	5750	5755	0 %	50 %	0 %	50 %	170289634
113	NC_010482	GCA	2	6	5763	5768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289634
114	NC_010482	GCT	2	6	5780	5785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289634
115	NC_010482	CCTC	2	8	5827	5834	0 %	25 %	0 %	75 %	170289634
116	NC_010482	TTA	2	6	5910	5915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170289634
117	NC_010482	GCT	2	6	5944	5949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289634
118	NC_010482	GAT	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289634
119	NC_010482	ATC	2	6	5977	5982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289634
120	NC_010482	CAGC	2	8	6048	6055	25 %	0 %	25 %	50 %	170289634
121	NC_010482	ATG	2	6	6062	6067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289634
122	NC_010482	CGCT	2	8	6144	6151	0 %	25 %	25 %	50 %	170289634
123	NC_010482	TC	3	6	6258	6263	0 %	50 %	0 %	50 %	170289634
124	NC_010482	CCTT	2	8	6264	6271	0 %	50 %	0 %	50 %	170289634
125	NC_010482	CCT	2	6	6343	6348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289634
126	NC_010482	GAC	2	6	6364	6369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170289634
127	NC_010482	G	6	6	6390	6395	0 %	0 %	100 %	0 %	170289634
128	NC_010482	TCC	2	6	6446	6451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289634
129	NC_010482	GAG	2	6	6458	6463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289634
130	NC_010482	GAG	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289634
131	NC_010482	GA	3	6	6576	6581	50 %	0 %	50 %	0 %	170289634
132	NC_010482	CT	3	6	6612	6617	0 %	50 %	0 %	50 %	170289634
133	NC_010482	TCA	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289634
134	NC_010482	T	7	7	6762	6768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010482	TCCT	2	8	6836	6843	0 %	50 %	0 %	50 %	170289635
136	NC_010482	TTGA	2	8	6851	6858	25 %	50 %	25 %	0 %	170289635
137	NC_010482	AAG	2	6	6983	6988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289635
138	NC_010482	CT	3	6	6995	7000	0 %	50 %	0 %	50 %	170289635
139	NC_010482	G	6	6	7026	7031	0 %	0 %	100 %	0 %	170289635
140	NC_010482	CT	3	6	7109	7114	0 %	50 %	0 %	50 %	170289635
141	NC_010482	TA	3	6	7115	7120	50 %	50 %	0 %	0 %	170289635
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263	NC_010482	TCCA	2	8	12946	12953	25 %	25 %	0 %	50 %	170289640
264	NC_010482	ACTT	2	8	12998	13005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
265	NC_010482	GA	3	6	13013	13018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
266	NC_010482	CCT	3	9	13129	13137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289641
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269	NC_010482	GGA	2	6	13300	13305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289641
270	NC_010482	GAA	2	6	13390	13395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170289641
271	NC_010482	GATAGG	2	12	13405	13416	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	170289641
272	NC_010482	AGG	2	6	13454	13459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289641
273	NC_010482	TTC	2	6	13487	13492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289641
274	NC_010482	TA	4	8	13589	13596	50 %	50 %	0 %	0 %	170289641
275	NC_010482	AGG	2	6	13603	13608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289641
276	NC_010482	CT	3	6	13617	13622	0 %	50 %	0 %	50 %	170289641
277	NC_010482	AG	3	6	13661	13666	50 %	0 %	50 %	0 %	170289641
278	NC_010482	TAC	2	6	13682	13687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170289641
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280	NC_010482	GAT	2	6	13760	13765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289641
281	NC_010482	AGG	2	6	13770	13775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289641
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284	NC_010482	GA	3	6	13891	13896	50 %	0 %	50 %	0 %	170289641
285	NC_010482	TTC	2	6	13929	13934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170289641
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287	NC_010482	G	6	6	14001	14006	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
288	NC_010482	GGA	2	6	14042	14047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289642
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290	NC_010482	GGA	2	6	14106	14111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289642
291	NC_010482	AG	3	6	14118	14123	50 %	0 %	50 %	0 %	170289642
292	NC_010482	AG	3	6	14160	14165	50 %	0 %	50 %	0 %	170289642
293	NC_010482	ATA	2	6	14184	14189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289642
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297	NC_010482	ATA	2	6	14379	14384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289642
298	NC_010482	AGGG	2	8	14403	14410	25 %	0 %	75 %	0 %	170289642
299	NC_010482	CT	3	6	14411	14416	0 %	50 %	0 %	50 %	170289642
300	NC_010482	AGG	2	6	14454	14459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289642
301	NC_010482	AGG	2	6	14535	14540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289642
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303	NC_010482	AG	3	6	14605	14610	50 %	0 %	50 %	0 %	170289642
304	NC_010482	GGATA	2	10	14639	14648	40 %	20 %	40 %	0 %	170289642
305	NC_010482	GA	3	6	14676	14681	50 %	0 %	50 %	0 %	170289642
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323	NC_010482	GTAG	2	8	15414	15421	25 %	25 %	50 %	0 %	170289643
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342	NC_010482	ATGG	2	8	16441	16448	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
343	NC_010482	GAGC	2	8	16458	16465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
344	NC_010482	CTC	2	6	16510	16515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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346	NC_010482	TAC	2	6	16553	16558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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349	NC_010482	TCT	2	6	16736	16741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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352	NC_010482	GCG	2	6	16801	16806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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355	NC_010482	AGCTC	2	10	16853	16862	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
356	NC_010482	TTG	2	6	16864	16869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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358	NC_010482	GCA	2	6	16921	16926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
359	NC_010482	AAT	2	6	16971	16976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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361	NC_010482	GAA	2	6	17065	17070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
362	NC_010482	AGG	2	6	17128	17133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
363	NC_010482	AGG	2	6	17152	17157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289644
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385	NC_010482	CATT	2	8	17877	17884	25 %	50 %	0 %	25 %	170289645
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388	NC_010482	GCT	2	6	17994	17999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170289645
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390	NC_010482	CTC	3	9	18075	18083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170289645
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392	NC_010482	GA	3	6	18171	18176	50 %	0 %	50 %	0 %	170289645
393	NC_010482	GGA	2	6	18241	18246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289645
394	NC_010482	TAA	2	6	18292	18297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170289645
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396	NC_010482	AGG	2	6	18384	18389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289645
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398	NC_010482	GGA	2	6	18474	18479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289645
399	NC_010482	AGG	2	6	18490	18495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289645
400	NC_010482	GGA	2	6	18571	18576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170289645
401	NC_010482	CCTT	2	8	18581	18588	0 %	50 %	0 %	50 %	170289645
402	NC_010482	GTG	2	6	18655	18660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
403	NC_010482	TGA	2	6	18737	18742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170289646
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